こんな論争があったんだ。

どっちでもよいように思うけれど、「子ども」という表記は子供っぽい気がするけどね。大人なら大人らしく漢字を使う方が文章も読みやすくなるようには思うけれど。
http://kan-chan.stbbs.net/word/pc/kodomo.html
http://homepage3.nifty.com/harebuta/gaki.htm
ちなみに、Googleで検索した結果は、「子供」のほうが多数派なようで。
子供 - 約 5,810,000 件
子ども - 約 3,610,000 件